氢气发生器在使用过程中遇到的问题有两个比较常见，一.可靠性难以保证，二.安全性存在问题。其可靠性难以保证具体表现在有部分发生器的纯度不够，氢气中含水量高而且还带有一定的腐蚀性，如果操作不当会有返液现象发生。
上述情况会造成色谱仪不容易稳定及色谱柱柱效降低等现象，严重时可使气路及色谱柱报废，甚导致色谱仪全部报废。其次，使用过程中安全性存在问题，有部分气体发生器压缩机在使用过程中会产生过热、气路进油、漏电等现象。不仅对色谱仪造成损害，严重时会危及操作人员生命安全。
因为色谱仪使用高纯氮或高纯氢做载气，为了应对上述问题，我们从氢气发生器、氮气发生器和空气压缩机安全可靠性三方面总结几点经验供大家参考。空气作为辅助气，其纯度要求不高，经过脱水除油后基本上能满足色谱仪分析要求。
先，氢气发生器主要由电解系统、压力控制系统、净化系统和显示系统组成。
电解采用目前膜分离技术，由红外光电反馈装置与开关电源组成的压力控制系统，使氢气的发生量根据输出的需要自动调整，维持输出流量和压力的稳定。
采用这种原理产生的氢气存在的主要的问题有：
1.加KOH水溶液的氢发生器所产生的氢气中含水量高且带有一定腐蚀性，容易造成色谱仪调试不稳定，一旦长时间使用该氢气做载气必然造成色谱柱柱效降低。
2.利用该原理产生的氢气如果长时间使用，会造成严重的返液现象。为了防止返液，厂家设计了各种装置来尝试解决这个问题。毕竟它还是要加液的，一旦防返液的装置出现故障就会造成气路及色谱柱报废，严重的甚可能导致气相色谱仪全部报废。
3.气体的纯度大多没有经过检测，虽然可以通过基线和柱子使用寿命判断其纯度，结果却是给色谱柱造成不必要的损失。所以，氢气作为辅助气还行，做载气纯度不够。在选择氢气发生器时优先考虑质量有保证的厂家。
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